Бах был непревзойденным мастером полифонии, в его инструментальных фугах, хоровых мотетах, «Музыкальном приношении», в «Искусстве фуги» она достигла наивысшего совершенства. Выдающееся историческое, художественное и педагогическое значение имеет его «Хорошо темперированный клавир» (прелюдии и фуги), утвердивший современный музыкальный строй. Кроме того, он написал «Страсти по Иоанну», свыше 200 духовных и светских кантат, инструментальные концерты, в том числе шесть «Бранденбургских концертов» для оркестра, многочисленные сочинения для органа, клавесина, «Итальянский концерт» и многое-многое другое.
Жизнь Баха всегда полностью зависела от княжеского двора и лютеранской церкви. Противоречие между гениальным воплощением передовых идей в его творчестве и положением зависимого служителя проходит через все периоды его жизни и творчества. В оценке современников Бах всю свою жизнь оставался провинциальным музыкантом среднего порядка, повышенного внимания к нему как к композитору не было. Надо сказать, что в те времена редко известность отечественных композиторов выходила за пределы княжеств и герцогств раздробленной феодальной Германии. У себя на родине Бах пользовался славой в основном как органист и мастер контрапункта. «Великим Бахом» в XVIII веке считали его сына Карла Филиппа Эммануила, оказывавшего покровительство своему отцу. Почти все произведения Баха остались при его жизни в рукописи.
Единственным изданием были выпущенные в 1708 году ноты его «Выборной кантаты» Бетховену и Моцарту, которые преклонялись перед гением Баха, была известна всего лишь незначительная часть его творчества.
Только в XIX веке произошло «возрождение» Баха. Спустя 100 лет после создания «Страстей по Матфею» впервые состоялось исполнение этого произведения, с которого начался все возрастающий интерес к творчеству великого музыканта. Постепенно были опубликованы все его сочинения. Современники высоко оценили их, например, М. И. Глинка указал на «Страсти по Матфею» и Мессу си-минор как на образцовые в своем роде произведения Баха назвали «колоссом новой музыки». А по словам Бетховена, Бах — это «праотец гармонии».
Умер Иоганн Себастьян 28 июля 1750 года, оставив свою многочисленную семью (всего у него родилось двадцать детей) в тяжелом материальном положении. В последний год жизни Бах перенес неудачную операцию на глазах и полностью ослеп. Но, несмотря на это, до последних дней он диктовал своему ученику ноты фуг и хоралов.
Из всех сыновей Иоганна Себастьяна Баха наиболее близок к нему по характеру творчества был старший сын Вильгельм Фридеман (1710–1784), композитор и органист. В своих клавирных и камерных произведениях он подготовил новый выразительный стиль, развитый братом Карлом Филиппом Эммануилом Бахом. Работал Вильгельм Фридман в Дрездене, Халле (Галле), поэтому его и назвали «халльским», или «галльским», Бахом, во многих других городах. Последние годы жизни он провел в нужде и постоянных скитаниях.
Карла Филиппа Эммануила (1714–1788) называли «берлинским», или «гамбургским», Бахом, так как в 1738–1767 годах он был придворным музыкантом в Берлине, а с 1767 года работал в Гамбурге. Второй сын Иоганна Себастьяна пользовался при жизни славой крупнейшего немецкого композитора и клавесиниста своего времени. Выразительный стиль Баха по характеру и идейному содержанию родствен течению «Буря и натиск» в немецкой литературе. Из его многочисленных произведений наибольшее значение имеет его клавирное творчество, особенно сонаты, новый жанр XVIII века, в развитии которого Баху принадлежит выдающаяся роль. Он подготовил методический труд «Опыт правильного способа игры на клавире», который имеет огромное значение для фортепианного исполнительства. Венские классики Гайдн, Моцарт, Бетховен признавали в «берлинском» Бахе своего учителя.
Меньше известен еще один сын И. С. Баха — Иоганн Кристоф Фридрих (1732–1795), композитор, клавесинист и капельмейстер, «бюккенбургский» Бах. Он работал в придворной капелле города Бюккенбурга. Его сын Вильгельм Фридрих Эрнст (1759–1845) стал популярным в свое время чембалистом и органистом.
Самый младший сын И. С. Баха — композитор и пианист Иоганн Христиан (1735–1782), «миланский», или «лондонский», Бах — пользовался мировой славой как автор опер (написал одиннадцать опер в итальянском стиле), симфоний, сонат и концертов для фортепиано, отличавшихся приятной певучестью, изящным «галантным» стилем. С 1754 года он жил в Милане, с 1762-го и до конца жизни — в Лондоне, где пользовался немалой популярностью. Музыка Баха оказала довольно заметное влияние на стиль молодого Моцарта.