27 октября Чан Кайши получил приглашение на Каирскую конференцию, которая открылась 22 ноября. А с 1 по 5 декабря (сразу же после Тегеранской конференции 28 ноября — 1 декабря) проходил второй этап встречи. Китайский генералиссимус имел на руках достаточно веский козырь: «Китай не сможет продержаться в войне, и поэтому не исключена его капитуляция». Он настаивал уделить больше внимания бирманскому театру действий: после того как противник будет изгнан из Бирмы, его следующим рубежом будет Северный Китай, а затем — Маньчжурия.
Отдавая дань победам СССР в войне с Гитлером, американцы настаивали на поддержании Китаем связи с северным соседом. США надеялись, что Советский Союз вступит в войну на Тихом океане.
8 августа 1945 года гоминьдановский лидер узнал о том, что СССР вступит в войну. В связи с этим он потребовал от своей армии подчиняться беспрекословно только ему, сохранять порядок и не переходить в другие армейские подразделения. Затем он отдал приказ Красной Армии Китая «оставаться на своих местах и ждать дальнейших указаний», «не предпринимать никаких самостоятельных шагов». 14 августа в Москве был подписан договор между СССР и Китаем о дружбе и сотрудничестве, а 15 августа пришло сообщение о капитуляции Японии.
Чан Кайши опасался, что СССР будет оказывать поддержку КПК, что и случилось: Советский Союз упрочил положение коммунистов в Китае, и для Гоминьдана назревал кризис. В августе 1945 года Чан Кайши направил председателю ЦК КПК Мао Цзэдуну телеграмму с приглашением прибыть в Чунцин для переговоров. 28 октября туда прибыла делегация коммунистов. Было подписано соглашение между двумя партиями и принято обязательство обеих сторон добиваться решения проблем демократическим путем, избегая гражданской войны. На втором этапе встречи (21 октября 1946 года) было принято решение о созыве Политической консультативной конференции с привлечением к ее участию Демократической лиги (в состав которой входила жена покойного Сунь Ятсена). 10 января того же года в Чунцине открылась конференция с участием гоминьдановцев, коммунистов, других политических партий, а также беспартийных политических деятелей. Конференция приняла решение о введении конституционного режима, о созыве Национального собрания, об образовании коалиционных органов власти и о создании единых вооруженных сил.
Пока проходили совещания, Чан Кайши выезжал в Мукден, чтобы лично руководить операциями против вооруженных сил КПК. Состоявшийся в начале марта пленум ЦИК Гоминьдана принял курс на форсированную подготовку к гражданской войне; 1 апреля Чан Кайши разорвал соглашение с компартией, а в конце июня его армия начала общее наступление против освобожденных районов. Началась гражданская война.
Предоставив возможность Чан Кайши уничтожить КПК, государственный департамент США объявил о прекращении посредничества США в Китае. Представительства компартии в Нанкине, Чунцине и Шанхае прекратили свою деятельность.
В начале 1947 года гоминьдановцам удалось успешно завершить военные операции в Восточном Китае, в марте они овладели Юньанем — оплотом коммунизма на протяжении десяти лет, а затем развернули наступление на Шаньдуне. Эти события сопровождались необычайным голодом в стране. Чан Кайши видел свою первейшую задачу в исправлении экономического кризиса в скорейшей борьбе с коммунистами. В 1947 году усилился террор против инакомыслящих. Была поставлена вне закона Демократическая лига — единственная легальная организация, находившаяся в оппозиции Гоминьдану.
Подавление оппозиции сопровождалось усилиями по «демократизации» режима. В декабре 1947 года была инсценирована 1-я предвыборная кампания в Китае. В списке кандидатов в президенты значились вдова Сунь Ятсена Сун Цинмен и Чан Кайши. В апреле 1948 года президентом Китая был избран Чан Кайши.
После завершения реорганизации НОАК (Национально-освободительная армия Китая) получила задачу окружить и уничтожить главные силы гоминьдановской армии в Северо-Восточном, Восточном и Северном Китае и не допустить их отхода в Центральный и Южный Китай. С осени 1948 по осень 1949 года НОАК осуществила ряд крупных наступательных операций Ляоси-Шэньянская, Хуанхайская, Пекин-Тянцзинь-Чжанцзякоуская и самая сложная, завершившаяся форсированием реки Янцзы. Осенью 1948 года Чан Кайши был вынужден заговорить об отставке (с сохранением за собой контроля в партии). Его обращения к великим державам с просьбой повлиять на развитие событий в стране не принесли успеха. В январе 1949 года подразделение НОАК, разгромив сюйчжоускую группировку Гоминьдана, вышли к северному берегу Янцзы. Путь на Нанкин был открыт. Тянцзинь пал 14 января 1949 года, лишив Пекин всякого щита. 2 марта крейсер «Чунцин» — гордость гоминьдановского флота — перешел на сторону компартии. Официально Чан Кайши ушел с поста президента 21 января 1949 года. Его заменил Ли Цзунжэнь, который, когда НОАК входила в Пекин (23 января), начал склоняться к сотрудничеству с КПК. Генералиссимус сохранил за собой влияние в партии, командование армией и распоряжение финансами. 22 января был назначен отъезд Чан Кайши и его сына Цзян Цзинго на родину. В марте 1949 года в освобожденной от чанкайшистов деревне Сибайко состоялся II пленум ЦК ПКП, где была поставлена задача превращения Китая в социалистическую республику. Гоминьдановцы тут же активизировались. Они видели единственное спасение для себя — вернуть генералиссимуса. Только его высокий дух мог спасти положение. Чан Кайши поступил предусмотрительно: подготовил стартовую площадку для бегства на Тайвань. 17 апреля Нанкинское правительство попросило его взять на себя обязанности президента. «Никаких переговоров с КПК!» — приказал Чан Кайши.