Первоначально Народная армия благодаря чехословацким частям достигла значительных успехов, 6 августа захватив Казань, где в качестве добычи ей досталась эвакуированная сюда часть золотого запаса России. Однако постепенно укреплялась дисциплина в Красной армии и увеличивалась ее численность. Чехословаки же не горели особым желанием воевать в России и с ростом сопротивления со стороны красных предпочитали воздерживаться от активного участия в боях. Чехословацкие эшелоны перемещались с Поволжья и Урала в Сибирь. Народная же армия демократического Комуча многими чертами напоминала русскую армию в эпоху Временного правительства. Многие части были недисциплинированны, офицеры там не пользовались авторитетом. Наиболее боеспособными частями были полки ижевских и боткинских рабочих, в августе 1918 года восставших против большевиков, а после подавления восстания прорвавшихся на соединение с Народной армией.
В сентябре войска Комуча потерпели ряд поражений. 10 сентября красные заняли Казань, 29-го — Симбирск. Среди офицеров все настойчивее раздавались требования военной диктатуры. 23 сентября для руководства всеми антисоветскими силами на Востоке была создана Уфимская директория во главе с эсером Н. Авксентьевым. Комуч отказался от претензий на верховную власть и стал называться Съездом членов Учредительного собрания.
В октябре Директория перебралась в Омск. Здесь 18 ноября ее при поддержке офицеров и казаков сверг адмирал Колчак. Авксентьев и часть членов Директории были высланы за границу. Другие были арестованы и после неудачного восстания омских рабочих против Колчака расстреляны. Ряд бывших членов Комуча, включая Вольского, уйдя в подполье, приняли решение прекратить вооруженную борьбу с советской властью.
2 августа 1918 года советская власть была свергнута на Севере России при поддержке англо-французских войск, высадившихся в Мурманске и Архангельске будто бы для защиты этих портов от германской угрозы и предотвращения скопившихся там военных материалов центральными державами. К власти здесь пришло правительство Северной области во главе с известным эсером Николаем Чайковским. Здесь численность войск интервентов, преимущественно английских, составляла около 25 тысяч человек. Численность русских антибольшевистских сил была в несколько раз меньше. Английское командование не предпринимало широкомасштабных наступательных действий, ограничиваясь попытками продвинуться навстречу чехословацким частям, наступающим с востока.
Официально красный террор был объявлен большевистским Совнаркомом постановлением от 5 сентября 1918 года после убийства 30 августа в Петрограде главы местной ЧК М. Урицкого студентом Л. Каннегиссером и неудавшегося покушения в тот же день в Москве на жизнь Ленина, совершенного профессиональной революционеркой Ф. Каплан. Оба покушавшихся, хотя и принадлежали к эсерам, действовали в одиночку, а не от лица партии. В ответ ЧК объявила, что впредь за покушения на представителей советской власти будут расстреливаться заложники из зажиточных классов населения, офицеров, интеллигенции и всех, заподозренных в контрреволюционной деятельности. Только в Петрограде после выстрелов в Урицкого и Ленина казнили 500 заложников.
В действительности красный террор был развернут гораздо раньше, по крайней мере, с начала 1918 года. Уже в январе этого года Совнарком объявил о создании «трудовых батальонов» из «буржуазии» Сопротивляющихся мобилизации в эти батальоны, равно как и «контрреволюционных агитаторов», предписывалось расстреливать на месте. В июне 1918 года Ленин требует «поощрять энергию и массовидность террора». А Троцкий провозглшал: «Устрашение является могущественным средством политики, и надо быть лицемерным ханжой, чтобы этого не понимать». 17 июля 1918 года по решению Ленина и Свердлова была расстреляна царская семья вместе с оставшимися верными ей слугами. Расстреливали крестьян, не желающих отдавать хлеб продотрядам или просто взятых в заложники за действия тех, кто восставал против Советской власти. Расстреливали бывших фабрикантов, банкиров, помещиков, депутатов Думы, офицеров… Лишь незначительная часть жертв красного террора действительно участвовала в контрреволюционных заговорах и в той или иной форме вела борьбу против советской власти.
В конце 1919 года специальная комиссия, созданная генералом Деникиным, определила количество погибших от проводимого советской властью террора в 1766 тысяч человек, включая 260 000 солдат и 54 650 офицеров, около 1,5 тыс. священников, 815 тысяч крестьян, 193 тысяч рабочих, 59 тысяч полицейских, 13 тысяч помещиков и более 370 тысяч представителей интеллигенции и буржуазии. Не исключено, что эти данные преувеличены, и в действительности многие из тех, кого включают в число жертв «красного террора», умерли от голода и болезней.