Это сражение решило исход войны. Русские, которых австрийцы обвинили в поражении, повернули на восток. Император Франц просил Наполеона о мире.
Бонапарт продиктовал Австрии унизительные условия мира, который был заключен в Пресбурге 26 декабря 1805 года. Австрия теряла все свои владения в Италии и Далмации. Тироль и Форарльберг она уступала Баварии. И за все свои территориальные потери она не получала никакой компенсации. Лишь прежние епископства Зальцбургское и Вюрцбургское отходили Габсбургам.
В марте 1806 года в качестве очередного этапа установления в Европе наполеоновских порядков последовало изгнание Бурбонов из Италии, где был назначен королем брат Наполеона, Жозеф. Только Сицилию, охраняемую английским флотом, корсиканец не смог завоевать. Луи Бонапарт стал новым королем Голландии, тем самым тоже полностью вошедшей в наполеоновскую систему.
С помощью своей семьи, членов которой он старался посадить на трон, пользуясь любой возможностью, он надеялся войти на равных в круг европейских царствующих фамилий. Поэтому большой удачей стал для него брак его приемного сына Эжена Богарнэ с Августой, дочерью короля Баварии Макса I, и брак его падчерицы, Стефани Богарнэ с наследником Баденского трона Карлом Жером получил в жены вюртембергскую принцессу. Кульминационным пунктом этой политики стал второй брак.
Наполеона в 1809 году с дочерью австрийского императора Марией-Луизой, после его развода с Жозефиной Богарнэ по причине бездетности их брака.
Наполеоновская политика перекраивания карты Германии, предусматривавшая создание в качестве противовеса Пруссии и Австрии на месте множества мелких княжеств самостоятельных, но зависимых от Франции второразрядных государств, увенчалась 20 января 1806 года основанием Рейнского союза. Шестнадцать немецких князей заключили союз под протекторатом Наполеона и обязались в случае войны выставить ему в помощь 63 000 солдат. Наполеон за это гарантировал «немецкую независимость» своей 200-тысячной армией и таким образом получил хороший предлог, чтобы оставить в Германии значительные военные силы.
В Южной Германии он чувствовал себя полным хозяином, как наглядно свидетельствует случай с книготорговцем Палмом. Этот торговец продавал антинаполеоновский памфлет «Глубочайшее унижение Германии». По приказу Наполеона он предстал перед французским военным судом и 26 августа 1806 года был расстрелян.
Пресбургский мир был только передышкой. Переговоры о мире с Англией и Россией провалились, и когда Наполеон на переговорах с Англией предложил вернуть ей Ганновер — принадлежащий тогда Пруссии! — это даже для Фридриха-Вильгельма III было уже слишком. 9 октября 1806 года Пруссия объявила Франции войну.
27 октября Наполеон вступил в Берлин. Прусская королевская чета бежала в Кенигсберг в Восточной Пруссии. Казалось, Прусскому государству пришел конец, силы сопротивления его войск были полностью сломлены. Однако предстояло еще одолеть Россию. 21 ноября 1806 года Наполеон в Берлине объявил континентальную блокаду Англии и объяснил, как он представляет себе экономическую войну с островной державой. Все прусские порты отныне должны были закрыться для английских товаров, все английские товары в стране подлежали конфискации. Наполеон принял решение контролировать все германское побережье. Вся Европа, по замыслу Наполеона, должна была, добровольно или в принудительном порядке, принять участие в этом бойкоте.
За быстрой победой над прусской армией последовал еще один тяжкий и кровопролитный поход на восток. 14 июня 1807 года Наполеон в решающем сражении разбил русскую армию при Фридланде. Русский царь созрел для заключения мира.
В Тильзите 7 июля 1807 года был заключен мир с Россией, и сразу же вслед за этим — договор о союзничестве. Россия присоединилась к континентальной системе. С Пруссией, чья армия до заключения перемирия отличилась во время доблестной защиты маленькой крепости Кольберг, Наполеон обошелся гораздо жестче. Не помогло даже личное вмешательство королевы Луизы.
В годы после Тильзитского мира император пытался запереть все европейское морское побережье для английского флота. Не желавших этому следовать он принуждал силой. Не в последнюю очередь именно это заставило его в 1808 году впутаться в испанскую авантюру, надолго превратившую Иберийский полуостров в театр военных действий Она стоила наполеоновской армии больших потерь и показала всему миру, что решительный и готовый на любые жертвы народ может успешно противостоять даже наполеоновской армии.