Нарастание протеста в стране и обусловленная этим позиция США, с которой невозможно было не считаться, вынудили Пака отказаться от плана продления военного режима и найти другие возможности для удержания власти. В конце августа 1963 года состоялся съезд Демократической республиканской партии, который выдвинул Пак Чжон Хи в качестве своего кандидата на пост президента. Для этого ему пришлось уйти с действительной военной службы. Основным соперником Демократической республиканской партии стала Партия демократического управления во главе с Юн Босоном.
На президентских выборах, состоявшихся 15 октября 1963 года, Пак Чжон Хи получил 42,6 процента голосов, а Юн Босон — 41,2 процента. ПеревесПаку создали голоса избирателей в сельскохозяйственных районах. Пак сразу же после прихода к власти провел ряд мер, рассчитанных на развитие деревни.
Государство взяло на себя часть крестьянской задолженности ростовщикам, выделило кредиты на ведение сельского хозяйства. В городах же Пак проиграл, так как, несмотря на некоторый рост доходов, горожане по-прежнему жаловались на дороговизну, недостаток жилья, политические неурядицы.
Если на президентских выборах Пак прошел с небольшим перевесом, то через месяц, на выборах в Национальное собрание, его партия добилась внушительной победы. 17 декабря 1963 года в Сеуле состоялась церемония провозглашения Третьей республики. Было объявлено, что ее создание положило конец режиму военной власти, продолжавшемуся два года и семь месяцев, и возвратило стране конституционную форму правления. После церемонии состоялось открытие вновь избранного Национального собрания. В тот же день приступил к выполнению своих обязанностей сформированный накануне гражданский кабинет. Почти все лица, вошедшие в кабинет, являлись сподвижниками Пак Чжон Хи.
Пак уделял огромное внимание укреплению государственного аппарата за счет кадров, прошедших, как правило, армейскую школу, и преданных лично ему. Его сторонники утвердились во всех звеньях государственного аппарата, особенно в ведущих учреждениях — военном и внешнеполитическом ведомствах, суде, прокуратуре, полиции, органах разведки и пропаганды.
Пак являлся активным сторонником государственного регулирования экономики, при этом в своей деятельности он стремился тесно сотрудничать с влиятельными финансистами и промышленниками. Ассоциация корейских предпринимателей, созданная в июле 1961 года и насчитывавшая 145 компаний и 31 корпорацию, стала оказывать прямое и непосредственное влияние на политику правительства. Ассоциация представляла правительству рекомендации по важным вопросам экономической деятельности, вела изучение хозяйственной конъюнктуры в стране и за рубежом, проводила обмен экономическими и торговыми миссиями с другими странами с целью изучения рынков.
Экономическая ситуация в Южной Корее постепенно улучшалась. Экономический рост был достигнут огромным напряжением трудовых ресурсов страны: 10-часовой рабочий день, 6-дневная рабочая неделя, только несколько суток отпуска в году — вот истоки сегодняшней экономической мощи Южной Кореи.
Правительство Пака неотступно преследовали такие вечные экономические проблемы, как безработица, дороговизна, нехватка жилья и особенно коррупция. Нерешенность этих вопросов привела в марте 1964 года к серии массовых антиправительственных выступлений в Сеуле и других городах.
3 июня 1964 года недовольство правлением Пака вылилось в требование его отставки. Масса демонстрантов, окружив в Сеуле дворец президента, скандировала требования об уходе Пака с политической арены. В стычках с полицией участники демонстрации ранили более 400 полицейских, захватили несколько армейских грузовиков, напали на два полицейских участка. Власти ввели военное положение и перебросили в Сеул две армейские дивизии, сумевшие быстро восстановить порядок.
3 мая 1967 года состоялись новые президентские выборы. Пак Чжон Хи без труда переиграл Юн Босона. Новый срок его правления ознаменовалсяусилением репрессий. Несмотря на то что запрет на деятельность оппозиционных партий был снят, всякая оппозиция жестоко подавлялась. Одновременно Пак готовил «правовые основания» для продления своего правления, так как Конституция 1962 года давала возможность одному и тому же лицу быть президентом только два срока подряд. Пак и его люди развернули кампанию за пересмотр конституции. Их усилия сводились прежде всего к тому, чтобы добиться внесения в конституцию поправки, которая позволила бы одному лицу занимать пост президента три раза подряд.