Для размещения нового оружия с «Бедового» были сняты артиллерия главного калибра, торпедные аппараты, противолодочное вооружение, а кормовая 45- мм установка была перенесена в нос. Чуть позднее на него поставили РБУ и два 2 – трубных торпедных аппарата для противолодочных торпед с системами управления для них. Стандартное водоизмещение экспериментального корабля составило 2850 т, причем в увеличении водоизмещения сыграл основную роль твердый балласт, уложенный для страховки – были опасения, что стартовый удар ракеты может опрокинуть корабль.
Поскольку 2 ПУ с 16 снарядами «КСЩ» просто физически не входили в корпус 56, совместное решение ВМФ и Минсудпрома от 16 апреля 1956 года предусматривало разработку рабочего проекта 56М, по типу «Бедового». Все отработанные решения оставались, водоизмещение кораблей пр. 56М возрастало на 85-100 тонн (плюс 100 тонн балласта).
Стабилизированная пусковая установка «СМ-59- 1» снабжалась рельсовыми направляющими, бронированной коробкой поста предстартовой подготовки (борт – 10 мм, палуба – 6 мм). Ракеты хранились в погребе без топлива и поэтому могли стартовать лишь через 15-20 минут. Обслуживал установку расчет из 18 человек. При всех недостатках, появление ракетного комплекса на корабле, несомненно, резко расширило его возможности по борьбе с более сильными надводными группировками противника и создало предпосылки качественного перевеса наших кораблей над иностранными – ведь эффективных средств борьбы с новым оружием просто не было.
Эсминец «Пламенный» (пр. 56 ПЛО) стреляет главным калибром
Эсминцы проекта 56М (головной «Прозорливый») отличались от «Бедового» внешне незначительно, однако существенно повышались возможности ПВО в результате замены «сорокапяток» на 57 мм артустановки «ЗИФ-75» (от РЛС «Фут-Б-2»), устанавливалась новая ГАС «Геркулес» МГ-572 с трактом кругового обзора, система управления стрельбой «Кипарис – 56М» была уже разработана специально для корабельных условий, ставились новые приемники радиоразведки, оборудован БИП с электронной системой «Планшет», внедрена система противоатомной и химической защиты, в результате чего корабли могли вести бой при полной герметизации помещений в течение трех часов, используя системы фильтровентилнции, орошения надстроек и пагуб. Была усовершенствована энергоустановка.
Снаряд «Щука», как принято считать, изначально был несовершенным и слабым. Тем не менее, если его умело применить против даже крупных артиллерийских кораблей, результат мог оказаться потрясающим. 16 июня 1961 года «Прозорливый» с дистанции в 72 км (целеуказание давалось с берега) выпустил но крейсеру(!) «Адмирал Нахимов» одну ракету КСЩ в инертном снаряжении. После попадания в средней части корабля образовалось отверстие в виде восьмерки, площадью около 15 квадратных метров, причем боеголовка пробила с другого борта бронированный корпус корабля ниже ватерлинии. Двигатель взорвался, разлитое топливо загорелось – пожар был потушен лишь через 12 часов. Таким образом, с недосягаемой для артиллерийского корабля противника дистанции его можно было поражать новым оружием практически безнаказанно. Испытания «Прозорливого» прошли успешно: радиолокационная наблюдаемость воздушных и надводных целей оказалась на 25% выше заданной. ГАС «Геркулес» была рекомендована к доработке – на этом корабле она почему-то работала лишь в двух крайних положениях, оказалась чувствительной к помехам, дальность обнаружения лодки (ход под перископом, скорость 3,5 узла) составляла 18 кабельтовых.
Прошедшая на «Прозорливом» испытания (в обломе 10686 выстрелов) новая четырехствольная установка «ЗИФ-75» имела дальность стрельбы до 13 км (6,7 км по высоте), массу заряда 1,19 (снаряда – 2,8 кг), скорострельность 100 выстрелов в минуту. По внешнему виду и конструктивно они с «СМ-20- ЗИФ» похожи.
Сразу же после окончания строительства серии возникла необходимость модернизации эсминцев проекта 56 в связи с усилением возможностей подводных лодок с появлением атомной энергетики и разработкой нового реактивного противолодочного оружия. Технический проект модернизации был разработан ЦКБ-53 на основании решения ВМФ и ГКС от 14 декабря 1957 года. Со следующего года и далее с кораблей снимается кормовой торпедный аппарат, вместо которого оборудованы посты ПЛО, ЗАС и другие помещения (вплоть до Ленинских комнат), вместо бомбосбрасывателей на корме устанавливаются реактивные бомбометы РКУ (2x6) с системой управления «Бурун» (дальность стрельбы до 115 м), а торпедные аппараты и ПУТС приспосабливаются под торпеды как для надводных, так и для подводных целей. В итоге водоизмещение кораблей возрастало на 420- 450 тонн, соответственно снижалась скорость. В 1962- 75 гг. по проекту 56-ПЛО оборудовано 14 эсминцев, позднее на них ставили 25-мм автоматы «2М-ЗМ» для борьбы с низколетящими ракетами. «Московский комсомолец» планировалось модернизировать по проекту 56ПМ, с установкой новой РЛС «Ангара» и буксируемой ГАС «Вега», но в связи с тем, что уже проектировались новые корабли с «Вегой», модернизация была осуществлена лишь частично, с установкой РБУ-6000 и ПУСБ «Буря» (для испытаний), а вместо «Веги» смонтировали опытное устройство неакустического поиска подводных лодок «Колос-2000», напоминающее внешне БГАС – испытания показали положительный результат по обнаружению и контакту атомных лодок по их радиоактивному следу.